Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RabggtaQ9JHK4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RabggtaQ9JHK4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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