Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cxcl11Q9JHH5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cxcl11Q9JHH5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cxcl11Q9JHH5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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