Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESL0

Oxct2b, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2bQ9ESL0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Oxct2bQ9ESL0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Oxct2bQ9ESL0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Oxct2bQ9ESL0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.2 ms