Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Erg28Q9ERY9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Erg28Q9ERY9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms