Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrnb2Q9ERK7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrnb2Q9ERK7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chrnb2Q9ERK7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms