Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chst1Q9EQC0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Chst1Q9EQC0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chst1Q9EQC0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chst1Q9EQC0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chst1Q9EQC0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chst1Q9EQC0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chst1Q9EQC0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chst1Q9EQC0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chst1Q9EQC0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chst1Q9EQC0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chst1Q9EQC0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chst1Q9EQC0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chst1Q9EQC0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chst1Q9EQC0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chst1Q9EQC0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chst1Q9EQC0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chst1Q9EQC0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms