Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
V1ra8Q9EQ48 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V1ra8Q9EQ48 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
V1ra8Q9EQ48 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1707.8 ms