Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Rpgrip1Q9EPQ2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rpgrip1Q9EPQ2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rpgrip1Q9EPQ2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms