Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clstn1Q9EPL2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clstn1Q9EPL2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clstn1Q9EPL2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms