Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ndufa8Q9DCJ5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ndufa8Q9DCJ5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufa8Q9DCJ5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms