Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpne8Q9DC53 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne8Q9DC53 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cpne8Q9DC53 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpne8Q9DC53 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.7 ms