Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp27a1Q9DBG1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp27a1Q9DBG1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms