Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ap1s2Q9DB50 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap1s2Q9DB50 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms