Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA5

1700016D06Rik, RIKEN cDNA 1700016D06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700016D06RikQ9DAA5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700016D06RikQ9DAA5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700016D06RikQ9DAA5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700016D06RikQ9DAA5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
1700016D06RikQ9DAA5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
1700016D06RikQ9DAA5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700016D06RikQ9DAA5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700016D06RikQ9DAA5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700016D06RikQ9DAA5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700016D06RikQ9DAA5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700016D06RikQ9DAA5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700016D06RikQ9DAA5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700016D06RikQ9DAA5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700016D06RikQ9DAA5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700016D06RikQ9DAA5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700016D06RikQ9DAA5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700016D06RikQ9DAA5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700016D06RikQ9DAA5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700016D06RikQ9DAA5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms