Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Q9D9H8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Q9D9H8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Q9D9H8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Q9D9H8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Q9D9H8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Q9D9H8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Q9D9H8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Q9D9H8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Q9D9H8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Q9D9H8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Q9D9H8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Q9D9H8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Q9D9H8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Q9D9H8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Q9D9H8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Q9D9H8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Q9D9H8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Q9D9H8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Q9D9H8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Q9D9H8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Q9D9H8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Q9D9H8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Q9D9H8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Q9D9H8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Q9D9H8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Q9D9H8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Q9D9H8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Q9D9H8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Q9D9H8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Q9D9H8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Q9D9H8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Q9D9H8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Q9D9H8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Q9D9H8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Q9D9H8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Q9D9H8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Q9D9H8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms