Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo2Q9D8S4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo2Q9D8S4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rexo2Q9D8S4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms