Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c6Q9D8P7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c6Q9D8P7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms