Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lin37Q9D8N6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lin37Q9D8N6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lin37Q9D8N6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms