Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arpc5lQ9D898 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arpc5lQ9D898 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arpc5lQ9D898 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arpc5lQ9D898 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms