Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nop56Q9D6Z1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nop56Q9D6Z1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms