Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubb4aQ9D6F9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tubb4aQ9D6F9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms