Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V6

Syap1, Synapse-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syap1Q9D5V6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Syap1Q9D5V6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syap1Q9D5V6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syap1Q9D5V6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms