Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lpcat2bQ9D5U0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lpcat2bQ9D5U0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lpcat2bQ9D5U0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms