Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3a3Q9D554 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sf3a3Q9D554 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3a3Q9D554 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms