Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrameQ9D4Z5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrameQ9D4Z5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms