Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931428L18RikQ9D4S9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms