Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930564D02RikQ9D4S4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930564D02RikQ9D4S4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930564D02RikQ9D4S4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms