Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gcc1Q9D4H2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gcc1Q9D4H2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gcc1Q9D4H2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gcc1Q9D4H2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms