Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syce1Q9D495 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syce1Q9D495 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syce1Q9D495 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms