Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R9

Taf7l, Transcription initiation factor TFIID subunit 7-like, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7lQ9D3R9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf7lQ9D3R9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf7lQ9D3R9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7lQ9D3R9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7lQ9D3R9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7lQ9D3R9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7lQ9D3R9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7lQ9D3R9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7lQ9D3R9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7lQ9D3R9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7lQ9D3R9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7lQ9D3R9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7lQ9D3R9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7lQ9D3R9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7lQ9D3R9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7lQ9D3R9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7lQ9D3R9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7lQ9D3R9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7lQ9D3R9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7lQ9D3R9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf7lQ9D3R9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf7lQ9D3R9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf7lQ9D3R9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms