Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4cQ9D3F6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4cQ9D3F6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms