Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rufy3Q9D394 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rufy3Q9D394 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rufy3Q9D394 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rufy3Q9D394 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rufy3Q9D394 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rufy3Q9D394 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rufy3Q9D394 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rufy3Q9D394 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rufy3Q9D394 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rufy3Q9D394 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rufy3Q9D394 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rufy3Q9D394 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rufy3Q9D394 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rufy3Q9D394 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rufy3Q9D394 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rufy3Q9D394 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rufy3Q9D394 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rufy3Q9D394 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rufy3Q9D394 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rufy3Q9D394 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rufy3Q9D394 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rufy3Q9D394 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rufy3Q9D394 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms