Protein–RNA interactions for Protein: Q9D309

Fam3b, Protein FAM3B, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3bQ9D309 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam3bQ9D309 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam3bQ9D309 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms