Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Z4

Senp8, Sentrin-specific protease 8, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp8Q9D2Z4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Senp8Q9D2Z4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Senp8Q9D2Z4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Senp8Q9D2Z4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Senp8Q9D2Z4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Senp8Q9D2Z4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Senp8Q9D2Z4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Senp8Q9D2Z4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Senp8Q9D2Z4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Senp8Q9D2Z4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Senp8Q9D2Z4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Senp8Q9D2Z4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Senp8Q9D2Z4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Senp8Q9D2Z4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Senp8Q9D2Z4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Senp8Q9D2Z4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Senp8Q9D2Z4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms