Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fndc8Q9D2H8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc8Q9D2H8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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