Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F8

Toporsl, Topoisomerase I-binding, arginine/serine-rich-like, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporslQ9D2F8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ToporslQ9D2F8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ToporslQ9D2F8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ToporslQ9D2F8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ToporslQ9D2F8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ToporslQ9D2F8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ToporslQ9D2F8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ToporslQ9D2F8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ToporslQ9D2F8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ToporslQ9D2F8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ToporslQ9D2F8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ToporslQ9D2F8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ToporslQ9D2F8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ToporslQ9D2F8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ToporslQ9D2F8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ToporslQ9D2F8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms