Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Batf3Q9D275 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Batf3Q9D275 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Batf3Q9D275 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Batf3Q9D275 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Batf3Q9D275 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Batf3Q9D275 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Batf3Q9D275 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Batf3Q9D275 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Batf3Q9D275 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Batf3Q9D275 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Batf3Q9D275 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Batf3Q9D275 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Batf3Q9D275 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Batf3Q9D275 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Batf3Q9D275 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Batf3Q9D275 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Batf3Q9D275 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Batf3Q9D275 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Batf3Q9D275 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Batf3Q9D275 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Batf3Q9D275 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Batf3Q9D275 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms