Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q6

Erp44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp44Q9D1Q6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Erp44Q9D1Q6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Erp44Q9D1Q6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Erp44Q9D1Q6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Erp44Q9D1Q6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Erp44Q9D1Q6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Erp44Q9D1Q6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Erp44Q9D1Q6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Erp44Q9D1Q6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Erp44Q9D1Q6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Erp44Q9D1Q6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Erp44Q9D1Q6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Erp44Q9D1Q6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Erp44Q9D1Q6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Erp44Q9D1Q6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Erp44Q9D1Q6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Erp44Q9D1Q6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Erp44Q9D1Q6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Erp44Q9D1Q6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Erp44Q9D1Q6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms