Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmbr1lQ9D1E5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmbr1lQ9D1E5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmbr1lQ9D1E5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms