Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D131 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D131 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D131 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D131 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D131 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D131 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D131 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D131 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D131 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D131 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D131 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D131 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D131 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D131 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D131 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D131 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D131 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D131 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D131 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D131 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D131 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D131 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D131 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D131 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D131 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D131 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D131 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D131 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D131 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D131 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D131 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D131 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D131 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D131 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D131 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D131 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D131 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D131 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D131 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D131 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D131 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D131 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D131 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D131 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D131 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D131 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D131 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D131 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D131 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D131 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D131 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D131 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D131 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D131 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D131 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D131 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D131 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D131 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D131 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D131 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D131 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9D131 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D131 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D131 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D131 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D131 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D131 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D131 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D131 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D131 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9D131 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D131 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D131 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D131 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D131 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D131 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D131 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D131 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9D131 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D131 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D131 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D131 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D131 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D131 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D131 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9D131 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D131 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D131 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D131 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D131 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D131 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D131 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D131 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D131 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D131 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D131 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D131 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D131 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D131 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1176.3 ms