Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm1Q9D103 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm1Q9D103 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm1Q9D103 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm1Q9D103 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm1Q9D103 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm1Q9D103 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ifitm1Q9D103 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ifitm1Q9D103 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm1Q9D103 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm1Q9D103 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm1Q9D103 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm1Q9D103 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ifitm1Q9D103 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm1Q9D103 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ifitm1Q9D103 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm1Q9D103 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm1Q9D103 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm1Q9D103 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm1Q9D103 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifitm1Q9D103 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifitm1Q9D103 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ifitm1Q9D103 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ifitm1Q9D103 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifitm1Q9D103 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Ifitm1Q9D103 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ifitm1Q9D103 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ifitm1Q9D103 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ifitm1Q9D103 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.1 ms