Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx17Q9D0I4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stx17Q9D0I4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx17Q9D0I4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms