Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Gtf2e1Q9D0D5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gtf2e1Q9D0D5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gtf2e1Q9D0D5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gtf2e1Q9D0D5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms