Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc47Q9D024 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc47Q9D024 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc47Q9D024 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
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