Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab3bQ9CZT8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3bQ9CZT8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3bQ9CZT8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms