Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dnajc18Q9CZJ9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dnajc18Q9CZJ9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnajc18Q9CZJ9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms