Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ61

Gm17509, Predicted gene, 17509, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17509Q9CZ61 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm17509Q9CZ61 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm17509Q9CZ61 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm17509Q9CZ61 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm17509Q9CZ61 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17509Q9CZ61 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17509Q9CZ61 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm17509Q9CZ61 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm17509Q9CZ61 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17509Q9CZ61 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17509Q9CZ61 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm17509Q9CZ61 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm17509Q9CZ61 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm17509Q9CZ61 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm17509Q9CZ61 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm17509Q9CZ61 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm17509Q9CZ61 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm17509Q9CZ61 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm17509Q9CZ61 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17509Q9CZ61 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17509Q9CZ61 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17509Q9CZ61 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17509Q9CZ61 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17509Q9CZ61 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17509Q9CZ61 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm17509Q9CZ61 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17509Q9CZ61 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm17509Q9CZ61 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17509Q9CZ61 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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