Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snf8Q9CZ28 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snf8Q9CZ28 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Snf8Q9CZ28 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms