Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prelid3bQ9CYY7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prelid3bQ9CYY7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prelid3bQ9CYY7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.8 ms