Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl11Q9CXW4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl11Q9CXW4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms